Nastavení programu jsou rozdělena na osobní a sdílená.

Osobní nastavení se ukládají do souboru typu .mtn, který je parametrem při spouštění. Každý uživatel může mít libovolný počet těchto uložených nastavení.

Osobní nastavení jsou:

- fakulta, školní rok a semestr

- zobrazované dny v týdnu (Soubor/Nastavení)

- rozložení (velikosti) oblastí v jednotlivých aplikačních módech

- proužkizace, tj. skrytí vybraných položek na osách učeben, okruhů a učitelů

- aplikační mód při startu

- velikost a typ písma

Sdílená nastavení jsou ukládána do databáze, ovlivňují všechny uživatele pracující nad sdílenými daty. Některá nastavení lze nastavit přímo z MetraNG, jiná lze nastavit programem Parametry.

Sdílená nastavení nastavitelná v Parametrech jsou:

- maximální počet dnů v týdnu (zobrazení pondělí-pátek/sobota/neděle)

- počty, začátky a délky vyučovacích hodin

- formát textového zobrazení okruhů studentů

- způsob zobrazení aplikačních módů

- přídavné týdny mimo standardní týdny výuky, zejména pro rozvrhování nepravidelné výuky a rozvrhu kombinovaného studia, událost harmonogramu VYUKANEDO

Sdílená nastavení nastavitelná v MetruNG jsou:

- styl (barva) okruhů a budov