Modul Plány a kontroly slouží k vytváření kontrol plnění povinností každého studenta vzhledem k jeho vlastnímu studijnímu plánu.V průběhu studia musí mít student v zadaných termínech splněny určité povinnosti, aby mohl ve studiu pokračovat. Nebo musí získat určitý počet kreditů apod. Studijní plán proto můžeme brát jako množinu různých kontrol, které jsou prováděny v určených termínech. Cílem je, aby kontroly povinností probíhaly na požádání referentky automaticky podle předem zadaných pravidel.
Studijní plány a jejich kontroly se připravují v programu Tajemník. Modul Pěnkava zapojený do programu Student řeší provádění kontrol.
Pro vytváření a opravu studijních plánů a s nimi souvisejících kontrol slouží okno Studijní plány - kontroly.
Toto okno dostaneme do popředí pomocí ikony 
, případně z jeho minimalizované podoby v dolní části pracovního okna.
, případně z jeho minimalizované podoby v dolní části pracovního okna.
Zvláštností a důležitou vlastností tohoto okna je to, že je svisle rozděleno na dvě poloviny.
Přepínač Studijní plány a k nim příslušející kontroly a Kontroly a kde jsou použity určuje, jakým způsobem se budeme dívat na vazby mezi plány a kontrolami.
Použité ovládací prvky:
- Poznámka k propojení stud. plánu s kontrolou - nepovinný údaj.
- Studijní plány - kódy a názvy plánů.
Okno pro editaci plánu či nový plán otevřeme kliknutím na ikonky
či 
, nebo dvojitým kliknutím na vybrané řádce studijního plánu, případně výběrem ze seznamu, který se otevře po stisknutí pravého tlačítka myši na daném řádku. Pro kopii studijního plánu klikněte na ikonku 
. Bližší popis práce s editací, vytvářením a rušením studijních plánů viz zde.
Tlačítko
otevře okno "Výběr bloků předmětů" s vybraným aktuálním plánem v položce "Plán obsahuje" viz. kapitola Bloky.
- "Počet studií" - zobrazuje se aktuální počet aktivních studentů (s výjimkou studijního stavu zanechal a absolvoval), kterým je přidělen vybraný studijní plán.
- Ikonka
Seznam termínů kontrol plánu otvírá pro konkrétní označený studijní plán okno Úseky studia a kontroly st. plánu
- V tomto okně jsou pro vybraný studijní plán zobrazeny všechny termíny kontrol v rámci studijních ročníků, zimního semestru a celého roku. Pokud existuje k danému časovému termínu alespoň jedna kontrola, je zde zobrazen zelený čtvereček. V dolní části okna se nachází seznam dalších kontrol plus kontroly prováděné vždy.
- Kontroly plnění povinností - jsou přiřazeny k jednotlivým studijním plánům, aby se dalo zjistit, zda student studuje dostatečně intenzivně a dostatečně kvalitně svůj obor.
Okno pro editaci kontroly či novou kontrolu otevřeme kliknutím na ikonky či , nebo dvojitým kliknutím na vybrané řádce kontroly, případně výběrem ze seznamu, který se otevře po stisknutí pravého tlačítka myši na daném řádku. Bližší popis práce s editací, vytvářením a rušením kontrol viz zde.
- Tlačítko Generování - slouží ke generování kreditních plánů pro dvouoborové studium na jedné fakultě. Tyto plány jsou určeny pro přidělení studentům - program Student, záložka Studium. Před generováním je potřeba vytvořit samostatné podplány pro příslušné "půlobory", které se v generování budou spojovat do plánů pro studenty. Při výběru plánů pro generování lze zvolit, zda se má do generování nového plánu přidat také obecný základ a kontrola plánem.
- Studijní plány a k nim příslušející kontroly - zobrazuje studijní plány a k zamodřenému plánu všechny kontroly, které jsou do tohoto studijního plánu zařazeny viz zde
- Kontroly a kde jsou použity - zobrazuje kontroly a k zamodřené kontrole všechny plány, ve kterých je kontrola využita viz zde
Filtr, třídění, velikosti a pořadí sloupců a velikost okna zůstávají pro daného uživatele zachovány i při příštím spuštění programu.